É o órgão de consulta, apoio e participação na definição das linhas gerais de atuação da AAI, I.P, e nas tomadas de decisão do Presidente, assegurando a participação e colaboração de entidades públicas e privadas na definição e execução das políticas migratórias.

O Conselho Nacional da Imigração é composto por:

1. O Presidente da AAI,  que preside, ou quem for por ele designado como seu representante;
2. Um representante da Direção de Estrangeiros e Fronteiras;
3. Um representante da Direção Geral de Inclusão Social;
4. Um representante da Direção Geral do Trabalho;
5. Um representante da Inspeção Geral do Trabalho;
6. Um representante do Instituto do Emprego e Formação Profissional;
7. Um representante da Direção Nacional de Política Externa;
8. Um representante da Direção Geral das Comunidades e Assuntos Consulares;
9. Um representante da Direção Nacional de Educação;
10. Um representante da Direção Geral do Ensino Superior;
11. Um representante da Direção Nacional da Saúde;
12. Um representante do Instituto Nacional de Previdência Social;
13. Um representante da Direção Geral dos Registos, Notariado e Identificação;
14. Um representante do Instituto Cabo-verdiana para Igualdade e Equidade de Género;
15. Um representante da Comissão Nacional para os Direitos Humanos e a Cidadania;
16. Um representante do departamento governamental responsável pela área do Turismo; 
17. Um representante da Inspeção Geral das Atividades Económicas;
18. Um representante da Casa do Cidadão;
19. Um representante da Associação Nacional dos Municípios de Cabo Verde;
20. Dois representantes das Câmaras de Comércio;
21. Dois representantes das Centrais Sindicais, sendo um para cada uma das Centrais Sindicais mais representativas do País; 
22. Um representante da Plataforma das ONG’s; 
23. Três representantes de comunidades imigrantes mais numerosas provenientes de países pertencentes à Comunidade Económica dos Estados da África Ocidental (CEDEAO) designadas pelas respetivas associações;
24. Três representantes de comunidades imigrantes mais numerosas não previstas na alínea anterior, designadas pelas respetivas associações, sendo um para cada uma comunidade;
25. Duas personalidades de reconhecido mérito na matéria de imigração, ou representantes do meio académico ou de Instituições de pesquisa ou de investigação com intervenção e/ou interesse científico no fenómeno migratório.

São competências do Conselho Nacional da Imigração:

1. Monitorizar a implementação de medidas, leis nacionais, tratados, acordos e outros instrumentos nacionais, regionais e internacionais relevantes para a gestão da imigração e temas conexos;
2. Dar parecer sobre leis, acordos e instrumentos jurídicos regionais e internacionais com implicações sobre a imigração, a mobilidade de estrangeiros e integração de imigrantes, a serem subscritos e/ou ratificados por Cabo Verde;
3. Validar instrumentos de gestão, diagnósticos, estudos, planos de ação, programas, projetos e termos de referência relacionados com a imigração e integração de imigrantes;
4. Facilitar a coordenação e a troca de informações entre os diferentes serviços com responsabilidades na gestão da imigração e de estrangeiros;
5. Contribuir para o aprofundamento do debate e do conhecimento sobre a situação e tendências da imigração em Cabo Verde;
6. Aconselhar o Presidente da AAI, I.P em matéria de gestão dos fluxos imigratórios, integração dos imigrantes e temas relacionados;
7. Pronunciar-se sobre as demais questões que lhe sejam submetidas pelo Presidente da AAI, IP; e
8. Aprovar o respetivo regulamento interno.

Enquanto órgão singular, é responsável pela orientação, administração e gestão da AAI, e dirige as suas atividades e serviços, assegura e responde pelo bom funcionamento da mesma com os mais amplos poderes de gestão e para, em quaisquer circunstâncias, agir em nome dela e representá-la perante terceiros, em conformidade com as orientações de gestão da superintendência previstas na lei e nos Estatutos da AAI.

São competências do Presidente:

1. Promover e assegurar a representação da AAI, I.P na esfera nacional e internacional;
2. Planear, coordenar e dirigir, interna e externamente, as atividades da AAI, I.P, com vista à prossecução das suas atribuições e ao bom funcionamento dos seus serviços:
3. Representar a AAI, I.P em juízo e fora dele;
4. Assegurar o relacionamento com o membro do Governo da superintendência, prestando todas as informações e esclarecimentos solicitados;
5. Submeter à superintendência todos os assuntos que, nos termos da lei, careçam da sua autorização prévia ou aprovação;
6. Elaborar os instrumentos de gestão previsional e os documentos de prestação de contas e submetê-los a aprovação da superintendência;
7. Promover e estabelecer protocolos e acordos de cooperação com outras entidades públicas ou privadas nacionais ou estrangeiras e submetê-los à homologação da superintendência;
8. Administrar o património da AAI, I.P, incluindo a aquisição e alienação de bens quando tal se encontre previsto no orçamento anual aprovado e nos limites estabelecidos pela lei;
9. Assegurar a gestão financeira da AAI, I.P;
10. Nomear, após homologação do membro do Governo de superintendência, os mediadores das ULI;
11. Preparar o regulamento orgânico e o código de conduta e submetê-los ao membro do Governo da superintendência para efeitos de aprovação;
12. Submeter para aprovação da superintendência o quadro de pessoal e o respetivo regime salarial, consoante as necessidades do serviço, nos termos da lei;
13. Dirigir, gerir e exercer ação disciplinar, incluindo o poder de aplicação de sanções disciplinares, sobre o pessoal ao serviço da AAI, I.P, nos termos da lei;
14. Propor ao membro do Governo da superintendência a criação ou encerramento de delegações ou outras formas de representação no país ou no estrangeiro;
15. Decidir quaisquer assuntos do âmbito das suas atribuições que não careçam de autorização ou aprovação da superintendência ou que não sejam da competência de outro órgão, nos termos da lei; e
16. O mais que lhe for cometido por lei.

É o órgão responsável pelo controlo da legalidade, da regularidade e da boa gestão financeira e patrimonial da AAI. 

Tem como competências as previstas no regime jurídico geral dos institutos públicos.